Keine Sorge, auch beim Kernel kann es noch gar nicht böse enden. Klar, ist ein falscher/korrupter Kernel da, oder ist die /boot partition gar leer, kommt das Gerät nicht über den Bootscreen hinaus. Aber als Faustregel: Solange du in den Download Mode kommst ist nichts verloren.
Ich empfehle jedem nach Installation der Recovery ein NANDROID backup, sowie das Sichern der EFS Partition. Hat man beides ist man gegen die meisten DInge gefeit.
Generell gilt: /system, /userdata, /boot, /recovery sind partitionen die selbst komplett gelöscht nicht schlimm sind.
Schlimmer wird es, wenn low level komponenten fehlen wie zB. PBL, SBL (Primary und Secondary Bootloader). Diese Dinge werden noch vor dem "normalen booten" ausgeführt.
Diese Komponenten kannst du dir wie das BIOS vorstellen. Sie initialisieren die Hardware etc.
Diese Low Level Programme sind in der Regel auch nicht "gemapped" (sind nicht als mmcblk device verfügbar) und man kann diese speicherbereiche nicht zugreifen, es sei denn man schreibt selbst ein systemprogramm mit C und spricht die adressen direkt an.